Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Treml1Q8K558 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Treml1Q8K558 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms