Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc5Q8K4Z2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms