Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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