Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms