Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rdh16f2Q8K3M1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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