Protein–RNA interactions for Protein: Q8K368

Fanci, Fanconi anemia group I protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanciQ8K368 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanciQ8K368 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanciQ8K368 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms