Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrdQ8K2M3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrdQ8K2M3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrdQ8K2M3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrdQ8K2M3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrrdQ8K2M3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms