Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms