Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c1Q8K284 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms