Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms