Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms