Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms