Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog3Q8CI04 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms