Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn2Q8CHX7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.9 ms