Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Csnka2ipQ8CH19 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Csnka2ipQ8CH19 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Csnka2ipQ8CH19 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms