Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Rbm28Q8CGC6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Rbm28Q8CGC6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Rbm28Q8CGC6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbm28Q8CGC6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Rbm28Q8CGC6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Rbm28Q8CGC6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Rbm28Q8CGC6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Rbm28Q8CGC6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Rbm28Q8CGC6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm28Q8CGC6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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