Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cc2d2aQ8CFW7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cc2d2aQ8CFW7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms