Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms