Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hpf1Q8CFE2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hpf1Q8CFE2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hpf1Q8CFE2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hpf1Q8CFE2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hpf1Q8CFE2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hpf1Q8CFE2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hpf1Q8CFE2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hpf1Q8CFE2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms