Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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