Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec10Q8CF98 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec10Q8CF98 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms