Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A430089I19RikQ8C9W1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms