Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf21bQ8C966 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf21bQ8C966 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms