Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dclre1bQ8C7W7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms