Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms