Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc22Q8C5N3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms