Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C5C9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms