Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rae1Q8C570 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rae1Q8C570 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms