Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc21aQ8C0S4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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