Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms