Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms