Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms