Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms