Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Usp38Q8BW70 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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