Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod1Q8BVA4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms