Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms