Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms