Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms