Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp54Q8BL06 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms