Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms