Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms