Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms