Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms