Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms