Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn3Q8BHH8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms