Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smndc1Q8BGT7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms