Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms