Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms