Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn34b3Q80ZS5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cldn34b3Q80ZS5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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