Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms